下面筆者談下藥廠設計之萃取設備。由于蛋白質遇到有機溶劑會引起變形，所以萃取一般只適用于抗生素等小分子生物物質的提取。萃取分液固萃取和液液萃取。液固萃取主要用于萃取菌絲體中的有效成分，如用丙酮從菌絲體中提取灰黃霉素。液固萃取設備通常采用攪拌罐，即將溶劑和菌絲體一起加入攪拌罐，進行充分攪拌，使有效成分從菌絲體中轉移到溶劑中。液液萃取是利用溶劑從發酵液中提取分離有效成分通常發酵液中含有大量的可溶性蛋白和糖類，在萃取過程中會產生嚴重的乳化現象導致很多靠重力分離的萃取設備（如萃取塔等）不能用于生物物質產品的萃取，而是多采用分離因數較高的分離機和萃取劑。生物制藥生產中常用的萃取設備有萃取罐、分級式萃取設備、多級離心萃取機、連續逆流離心萃取機等。
（1）藥廠設計之萃取罐 萃取罐上部為圓柱形，下部為圓錐形，一般應用于分配系數較大的場合。
（2）藥廠設計之分級式萃取設備 分級式萃取設備又稱分段式萃取設備，由混合設備和分離/分層設備組成，分級式萃取設備是目前生物制藥生產中應用較多的設備。分級式萃取設備的混合設備有混合罐、管式混合器、噴射式混合器、離心泵等。
在分級式萃取過程中，當混合設備完成混合提取后，需要在分離設備中進行分層分離。由于發酵液易在兩相間產生穩定的乳濁液，即使加入去乳化劑，仍難將兩者靠重力在短時間內加以分開，實際生產中多采用離心分離機，包括管式離心機和碟片式離心機。管式離心機分離因數高，但處理量小。碟片式離心機生產能力大，但價格高、拆洗不便。液液分離型碟片式離心機與液固分離型碟片式離心機結構相似，不同之處是每塊碟片都開有內圈和外圈兩排孔，但最下面的一塊碟片只有一排孔。當乳濁液中重液量小于50％時，選用最下面的一塊碟片是外圈孔的碟片式離心機；當乳濁液中重液量大于50％時，選用最下面的一塊碟片是內圈孔的碟片式離心機。
（3）藥廠設計之多級離心萃取機 多級離心萃取機萃取效率高、溶劑消耗少、結構緊湊、占地面積小、液體在機內停留時間短，并可處理黏度高、易乳化、密度小的物系；其缺點是結構復雜、操作費用高。圖7-28為蘆威式離心萃取機，屬三級離心萃取機，其主體是固定在殼體上并可隨之做高速旋轉的環形盤。殼體中央有固定不動的垂直空心軸，軸上也裝有圓形盤，盤上開設有若干個液體噴出孔。
（4）藥廠設計之連續逆流離心萃取機 連續逆流離心萃取機是將溶劑與料液在逆流情況下進行微分接觸的設備，有臥式和立式兩種。臥式離心萃取機型號較多，典型機型有美國波德式離心萃取機，簡稱POD離心萃取機。該機適用于兩相密度差小易產生乳化的物系，生產能力為0.225～17m3/h.采用該機進行青霉素萃取最大理論級數可大于兩級，當溶劑與料液之比為1/6時，收率可達96％。立式離心萃取機型號較多，如國產機型LC-500型離心萃取機，其生產能力為5m3/h
（5）藥廠設計之臥式沉降螺旋卸料離心機 當臥式沉降螺旋卸料離心機配有向心泵時可以進行輕液重液固體三相分離，可用于直接從發酵液中進行萃取，在一臺機器內同時完成液固分離和萃取兩個單元操作
（6）藥廠設計之超臨界流體萃取設備 超臨界流體萃取設備具有精餾和液相萃取的特點，即在萃取過程中由于被分離物質間的揮發度的差異和它們分子間親和力的不同，這兩種因素同時發生作用而產生相際分離效果。二氧化碳超臨界流體萃取設備主要包括:萃取釜、分離器、CO2儲罐、換熱器、精餾柱等，其中萃取釜為核心設備。