真菌一般比細菌大幾倍至幾十倍，用普通光學顯微鏡放大幾百倍就能清晰地觀察到。按形態真菌可分為單細胞和多細胞真菌兩類，下面成都凈化工程公司就介紹下潔凈室施工之真菌的形態。
①單細胞真菌。單細胞真菌稱為酵母菌，呈圓形或卵圓形，直徑為3～15m，以出芽方式繁殖，芽生孢子成熟后脫落成獨立的個體。能引起人類疾病的有新生隱球菌和白假絲酵母菌等。
②多細胞真菌。稱為霉菌（Mold）或絲狀菌，由菌絲和孢子組成，菌絲與孢子交織在一起。各種霉菌的菌絲和孢子形態不同，是鑒別真菌的重要標志。
（1）菌絲
菌絲呈管狀，直徑一般為2～10μm，其長度隨不同生長條件而異。菌絲是孢子以出芽方式繁殖時形成的。在適宜的環境條件下由孢子長出芽管，逐漸延長成菌絲，菌絲又可長出許多分枝，并交織成團，成為菌絲體。菌絲在形態、結構及功能方面有所不同。按功能不同可分為營養菌絲、氣中菌絲和生殖菌絲，能伸入培養基中吸取營養物質的菌絲，稱為營養菌絲；能向空氣中生長的菌絲，稱為氣中菌絲；氣中菌絲中的可產生孢子的菌絲，稱為生殖菌絲。
按結構不同可分為有隔菌絲和無隔菌絲；前者在菌絲內能形成橫的隔膜，將菌絲分成數個細胞；后者的菌絲內無隔膜，整條菌絲僅為一個細胞，其內含有多個細胞核。大多數致病性真菌的菌絲為有隔菌絲。按形態不同可分為螺旋狀、球拍狀、結節狀、鹿角狀、梳狀和關節狀菌絲等。不同真菌的菌絲形態有所不同，這有助于鑒別真菌。
（2）孢子
孢子是真菌的繁殖體，根據繁殖方式分為有性孢子和無性孢子兩種。病原性真菌大多是通過形成無性孢子而繁殖。無性孢子按形態不同分為三種。
①分生孢子。分生孢子是真菌中最常見的一種無性孢子，由生殖菌絲末端的細胞分裂或收縮形成，也可由菌絲側面出芽形成。分生孢子又分為大分生孢子和小分生孢子兩種。
a.大分生孢子。由多個細胞組成，體積較大，多呈梭狀、棒狀或梨狀。
b.小分生孢子。僅由一個細胞構成，體積小因各種真菌都能產生小分生孢子，其對真菌的鑒別意義不大.
②葉狀孢子。葉狀孢子由菌絲內細胞直接形成。有以下三種類型。
a.芽生孢子。由細胞出芽生成，多數芽生孢子生長到一定大小即與母體脫離，若不脫離，形成菌絲狀，被稱為假菌絲。隱球菌和假絲酵母菌等是以芽生孢子的方式繁殖，假絲酵母菌易形成假菌絲。
b.厚膜孢子。由菌絲內胞漿濃縮、胞壁增厚形成，是真菌抵抗不利環境而形成的一種孢子形式，其代謝降低，抵抗力增強。厚膜孢子在適宜的條件下又可出芽繁殖。大多數真菌在不利環境中都能形成厚膜孢子。
c.關節孢子。由菌絲細胞壁變厚并分隔成長方形的節段而形成，多出現于陳舊的培養物中。
③孢子囊孢子。菌絲末端膨大形成孢子囊，內含許多孢子，孢子成熟后則破囊而出。如毛霉、根霉等形成孢子囊孢子。
部分真菌在不同的環境條件下（營養、溫度等）可發生單細胞真菌與多細胞真菌兩種形態的可逆轉換，稱為真菌的雙相性或二相性。如組織胞漿菌和球孢子菌等，它們在室溫（25℃）條件下發育為絲狀菌，而在宿主體內或在含有動物蛋白的培養基上、37℃培養時則呈酵母菌型。雙相性轉換與某些真菌的感染性和致病性有關，如組織胞漿菌和皮炎芽生菌等真菌在入侵宿主前必須發生形態變化方能侵入機體。