食品生產車間在加工操作過程中不可避免地會有液體流到地面上，或需要沖洗設備的內外表面。因此，車間地面應有適當的排水斜度（應在1％～2％）及排水系統。
排水形式可分為兩種:地漏排水和明溝排水。采用地漏排水，地漏周圍地面向地漏洞傾斜坡度為2％，地漏洞公稱直徑為100mm，可集地漏周圍半徑12m地面水流排出。地漏與排水管道以彎頭連接，要有水封裝置，防止蟲、鼠和臭氣從排水管道進入車間。連接排水管處要有可清潔排渣口，防止管道堵塞。如果生產過程中有帶渣、雜物等或排水量較大，如原料清洗及操作工段，可設置明溝排水，但距離應盡量縮短。
明溝排水時，明溝寬20～30cm，深15～40cm，坡度為1％～2％。車間內的明溝上應鋪設有網孔的蓋板。明溝終點設置排水地漏接通排水管道，此處應對廢水進行適當的過濾并設置過濾物排除的裝置，防止排水管道堵塞明溝應保持順暢，且溝內不得設置其他管路。排水溝的側面和底面接合處應有適當的弧度（曲率半徑應在3cm以上）。車間內排水溝的流向不得由低清潔區流向高清潔區，且應有防止逆流的設計。
食品工廠潔凈間的地漏等排水設施的設置應符合下列要求:
1、空氣潔凈度等于或嚴于6級的潔凈室內不得設置地漏；
2、潔凈室內地漏應采用有密封蓋的專用地漏；
3、等于或嚴于7級的潔凈室內不得穿過排水立管；
4、等于或嚴于7級的潔凈室內不宜設排水溝；
5、其他潔凈間（不含生物潔凈間）內穿過排水立管時不應設檢查口
如上所述，在潔凈間排水時應選用帶蓋的不銹鋼潔凈地漏以及無菌地漏、防臭地漏等潔凈間專用地漏，以便于疏通、清理，實現潔凈間的密封。
需要注意的是，在排水出口處也應設有防止老鼠、蟑螂等有害動物侵的裝置。