之前筆者介紹了藥廠凈化車間設備的清潔方式，本篇我們談下藥廠凈化車間設備清潔劑的選用標準。
對于藥廠凈化車間中的設備來說，使用的清潔劑應能有效溶解殘留物，不腐蝕設備，且本身易被清除，隨著環境保護標準的提高，還應要求清潔劑對環境盡量無害或可被無害化處理，并且應盡量廉價。根據這些標準，對于水溶性殘留物，水是首選的清潔劑。
從驗證的角度，不同批號的清潔劑應當有足夠的質量穩定性。因此不提倡采用一般家用清潔劑，因其成分復雜、生產過程中對微生物污染不加控制、質量波動較大且供應商不公布其詳細組成。使用這類清潔劑后，還會帶來另一個問題，即無法證明清潔劑的殘留達到了標準。
應盡量選擇簡單、成分確切的清潔劑。根據殘留物和設備的性質，企業還可自行配制成分簡單效果確切的清潔劑，如一定濃度的酸、堿溶液等。企業應有足夠靈敏的方法檢測清潔劑的殘留情況，并有能力回收或對廢液進行無害化處理。
一般來說，生產后清潔用到的清潔劑通常分為以下4類。
一、水
水通常用于藥品預沖洗、最終沖洗和稀釋液的配制，但是對于水容易清潔的殘留物，水也可以直接作為清潔劑使用。清潔用的水包括自來水、軟化水、純化水、注射用水等，通常情況下，用于最終淋洗的水質至少與藥品生產用水相當，清潔用水的質量還應符合適用其用途的化學、微生物與內毒素限度要求。水是用來清潔藥廠凈化車間設備最常用的清潔劑了。
二、有機溶劑
有機溶劑一般用于原料藥合成工藝中的清潔，溶劑的選擇基于殘留物在溶劑中的溶解性。有機溶劑作為清潔劑在清洗設備后，會在設備表面有大量殘留，應對其進行嚴格控制，降低對藥品生產的影響。
三、酸和堿
酸堿溶液的強酸堿性會促進水解，對大分子有機物進行水解破壞，使殘留物結構簡化易于清除。酸堿清潔劑有組分單一、價格低廉同時容易清除等優點，但是市售清潔劑中，如氫氧化鈉，對于強烈吸附或干燥的殘留物清潔效果有限，并且還有一定的吸潮性和污物懸浮作用。
四、配方清潔劑
配方清潔劑含多種成分，利用不同的清潔機制，因此具有更廣泛有效的清潔作用，除了具有市售堿的堿性作用和水解作用外，配方洗滌劑可能提供更好的潤濕和污物滲透性，乳化等相互作用。