對于藥廠潔凈室來說，為了滿足空氣潔凈度的要求，是必須相應的隔離措施的，而分區(qū)是平面規(guī)劃上防止污染和交叉污染的有效措施之一，隔離也是這種有效措施之一，特別是防止由空氣流動引起的污染和交叉污染的有效措施之一。
根據空氣潔凈技術原理，隔離的概念可以歸結為三種:
物理隔離——利用平面規(guī)劃時設置的抗?jié)B性屏障，對可能引起污染和交叉污染的空氣流動進行物理阻隔。
靜態(tài)隔離——即壓差隔離。在平面規(guī)劃時，把需正壓或負壓大的房間設在盡頭或中心。
動態(tài)隔離——即流動氣流隔離。在平面規(guī)劃時，在有常開洞口的區(qū)域考慮動態(tài)隔離。
一、藥廠潔凈室的靜態(tài)隔離
通過在兩個相鄰區(qū)域之間建立壓差，可防止污染由于某種因素的帶動而通過區(qū)域間的縫隙或開門瞬間，由低壓一側進入高壓一側。
潔凈室的靜壓差實質上是在該室門窗關閉條件下，定量空氣通過門窗等縫隙向外（內）滲透的阻力。縫隙越小，滲過定量空氣需要的壓差△越大，此時通過縫隙的速度也越大，如通過某小縫隙時在5Pa壓差下的滲透量和某大縫隙在1Pa壓差下的滲透量若相同，則通過小縫隙的速度將要大2.23倍。
二、藥廠潔凈室的動態(tài)隔離
對于一個常開的洞口來說，要靠壓差來抵擋洞口另一側的污染是不現實的，例如，一個0.2m×0.2m的洞口，當其兩側房間維持5Pa壓差時，通過該洞口從一邊流向另一邊的空氣量將達到416m3/h，對于不是很大的房間來說，多補充這樣多的新風是很困難的。
當在平而規(guī)劃時必須在相鄰區(qū)域間開這樣的洞口時，德國最早提出的流動空氣抵抗污染的概念可以被用于這種場合，而最近則被國際標準ISO明確用于隔離污染，并提出通過孔洞的氣流速度應大于0.2m/s。要注意這一速度是不適用于開門這種情況的。之所以采用0.2m/s，是因為除去另一側直接向洞口吹風外，正常的氣流流動速度一般不超過0.2m/s，另一側靠正常氣流流動速度是不容易穿過有速度大于0.2m/s的外流氣流的洞口而進入另一側的。
假定此洞口仍為0.2m×0.2m，則保持0.2m/s的外流氣流速度，兩側只需約0.04Pa的壓差，也就是說兩側壓差小到測不出來，甚至因測定誤差而可能出現負值的結果。
如果在防止來自洞口外的污染的同時還要防止來自與另外相鄰區(qū)域的縫隙的污染，則上述這點正壓差是微不足道的，那就要考慮抵擋縫隙滲透的污染，對洞口采取其他措施了。