（1）由于想要建造生物安全實驗室的單位逐漸增多，一些對生物安全實驗室一知半解的公司也想擠入生物安全實驗室的建設市場。但由于生物安全實驗室的特殊性，特別是在技術上和生物安全上的一系列特殊的要求，如果沒有建設過高級別的生物安全實驗室或者對生物安全實驗室不甚了解，很難建造出合格的生物安全實驗室，造成人力物力上的浪費。
一些非正規的單位雖然利用低價競爭，強占市場，已經取得一些工程業績，然而業績不等于專業，低價更不等于優質，其所謂的工程業績，充其量只能是負壓實驗室，與安全性極高的生物安全實驗室相去甚遠。
（2）目前國內有能力承接高級別生物安全實驗室設計和施工任務的企業并不多，因此用戶在選擇承建單位時要特別謹慎。應當選擇那些曾經設計或建造過高級別生物安全實驗室并且具有相關資質的企業，這是對自己負責，也是對社會負責。特別應該強調的是，生物安全實驗室的空氣凈化和負壓控制系統比一般的采暖通風空調系統要重要得多，必須進行詳細的設計計算。
（3）近年來，一些國外企業也在國內建造了一些三級生物安全實驗室，其中某些是成功的，但也確有一些存在某些缺陷，主要是他們對生物安全實驗室的技術要點不十分清楚。因此，盡管他們使用了許多高級昂貴的建筑材料，但仍然不符合要求。還有一些小公司，打著國外公司的牌子，而他們提供的設計圖紙實質上是普通的負壓試驗室，根本無法達到生物安全實驗室的要求。