對制藥廠廠區進行區域劃分后，即可根據各區域的建筑物組成和性質特點進行總平面布置。圖1為某藥廠的總平面布置圖，制藥廠廠址所在位置的全年主導風向為東南風，因此，辦公區、生活區均布置在東南上風處，多種制劑車間布置在原料藥生產區的上風處，而原料藥生產區則布置在下風處。庫區布置在廠區西側，且原料倉庫靠近原料藥生產車間，包裝材料倉庫和成品倉庫靠近制劑車間，以縮短物料的運輸路線。全廠分別設有物流出入口、人流出口和自行車出入口，人流、物流路線互不交叉。在辦公區和正門之間規劃了3片集中綠地，出入廠區的人流可在此處集散，并使人有置身于園林之感。制藥廠廠區主要道路的寬度為10m，次要道路的寬度為4m或7m，采用發塵量較少的水泥路面。制藥廠綠化設計按GMP的要求，以不產生花絮的樹木為主，并布置大面積的耐寒草皮，起到減塵、減噪、防火和美化的作用。
圖1中的AB坐標系為建筑施工坐標系，A軸與南圍墻平行。在總平面布置中，為準確標定建（構）筑物的位置，常采用地理測量坐標系或建筑施工坐標系。
（1）地理測量坐標系 又稱為XY坐標系，這是國家測繪局規定的坐標系，該坐標系以南北向增減為X軸，東西向增減為Y軸。在XY坐標系中作間距為50m或100m的方格網，并標定出廠址和各建筑物的地理位置。
（2）建筑施工坐標系 若制藥廠廠區和建筑物的方位不是正南正北方向，即與地理測量坐標網不是平行的，而存在一定的方位角此時，用地理測量坐標網對廠區或建筑物進行定位，就必須經過繁瑣的換算，很不方便為減少廠區和建筑物定位時的麻煩，總平面設計常采用與廠區和建筑物方位一致的建筑施工坐標系。建筑施工坐標系的坐標軸分別用A和B表示，故又稱為AB坐標系。在AB坐標系中作間距為50m或100m的方格網，并標定出廠址和各建筑物的地理位置。由于AB坐標系以廠區或建筑物的方位為坐標軸，故在確定廠區和建筑物的位置時可避免繁瑣的換算，并給現場施工放線帶來了方便。
圖1