在制藥的過程中，會產生許多的廢水，制藥廠的廢水處理設計是制藥廠設計的重要設計環節，下面華盛興邦就談下制藥廠的各種制藥廢水處理設計。
一、含懸浮物或膠體的廢水
制藥廠廢水中所含的懸浮物一般可通過沉淀、過濾或氣浮等方法除去。氣浮法的原理是利用高度分散的微小氣泡作為載體去粘附廢水中的懸浮物，使其密度小于水而上浮到水面，從而實現固液分離。例如，對于密度小于水或疏水性懸浮物的分離，沉淀法的分離效果往往較差，此時可向水中通入空氣，使懸浮物粘附于氣泡表面并浮到水面，從而實現固液分離。也可采用直接蒸汽加熱、加入無機鹽等，使懸浮物聚集沉淀或上浮分離。對于極小的懸浮物或膠體，則可用混凝法或吸附法處理。
除去懸浮物和膠體的廢水若僅含無毒的無機鹽類，一般稀釋后即可直接排入下水道。若達不到國家規定的排放標準，則需采用其他方法進一步處理。
從廢水中除去懸浮物或膠體可大大降低二級處理的負荷，且費用一般較低，是一種常規的廢水預處理方法。
二、酸堿性廢水
制藥廠制藥過程中常排出各種含酸或堿的廢水，其中以酸性廢水居多。酸堿性廢水直接排放不僅會造成排水管道的腐蝕和堵塞，而且會污染環境和水體。對于濃度較高的酸性或堿性廢水應盡量考慮回收和綜合利用，如用廢硫酸制硫酸亞鐵，用廢氨水制硫酸銨等。回收后的剩余廢水或濃度較低、不易回收的酸性或堿性廢水必須中和至中性。中和時應盡量使用現有的廢酸或廢堿，若酸、堿廢水互相中和后仍達不到處理要求，可補加藥劑進行中和。若中和后的廢水水質符合國家規定的排放標準，可直接排入下水道，否則需進一步處理。
三、含無機物的廢水
制藥廠的制藥廢水中所含的無機物通常為鹵化物、氰化物、硫酸鹽以及重金屬離子等，常用的處理方法有稀釋法、濃縮結晶法和各種化學處理法。對于不含毒物又不易回收利用的無機鹽廢水可用稀釋法處理。較高濃度的無機鹽廢水應首先考慮回收和綜合利用。例如，含錳廢水經一系列化學處理后可制成硫酸錳或高純碳酸錳，較高濃度的硫酸鈉廢水經濃縮結晶法處理后可回收硫酸鈉等。
對含氰化物、氟化物等劇毒物質的廢水一般可通過各種化學法進行處理。例如，用高壓水解法處理高濃度含氰廢水，去除率可達99.99％以上。
四、含有機物的廢水
在制藥廠排放的各類廢水中，含有機物廢水的處理是最復雜、最重要的課題。此類廢水中所含的有機物一般為原輔材料、產物和副產物等，在進行無害化處理前，應盡可能考慮回收和綜合利用。常用的回收和綜合利用方法有蒸餾、萃取和化學處理等。回收后符合排放標準的廢水，可直接排入下水道。對于成分復雜、難以回收利用或經回收后仍不符合排放標準的有機廢水，則需采用適當方法進行無害化處理。
有機廢水的無害化處理方法很多，可根據廢水的水質情況加以選用。對于易被氧化分解的有機廢水，一般可用生物處理法進行無害化處理。對于低濃度、不易被氧化分解的有機廢水，采用生物處理法往往達不到規定的排放標準，這些廢水可用沉淀、萃取、吸附等物理、化學或物理化學方法進行處理。對于濃度高、熱值高、又難以用其他方法處理的有機廢水，可用焚燒法進行處理。