與一般空調系統相比，排風系統在凈化空調系統中更具有舉足輕重的地位。對于凈化空調系統，處理新風所需能耗更多，而且新風量增加將加重過濾器負荷，縮短其使用壽命。此外因潔凈室氣密性好，而通道較迂回，一般車間疏散障礙多，因此對排毒、防爆、防火等的排風安全性更苛求。排風量大就意味著補入的新風量要多，系統的初投資與運行費都將相應上揚。對于制藥工業來說，還有防止排風攜帶某些強致敏性或毒性藥物污染大氣，以及回收排風中所攜帶的藥物有效成分等問題。下面華盛興邦就談下藥廠設計之凈化車間排風系統設計。
在藥廠設計中，為了防止生產過程所產生、發散的粉塵或其他有害物污染室內空氣最有效的方法是:在有害物產生地點直接將其捕集起來，經過必要的凈化處理后排至室外。這種通風方式稱為局部排風。其特點是所需風量小，效果好，藥廠設計時應優先采用。為了提高捕集效率，宜在污染物發生處設置與工藝設備相配合的局部排風罩。在不妨礙操作的條件下，應盡可能使排風罩把污染源包圍和封閉起來，操作的敞口盡可能小。這樣既可減少其向室內擴散，又可用較小的排風量有效地帶走污染物。例如壓片機和膠囊填充機常采用透明樹脂材料制成的所謂圍簾式吸塵罩，把整個機器罩起來，而攪拌機和篩濾機等設備的投料部分常采用外裝式吸塵罩，此外還有向上抽風式、側面抽風式吸塵罩、小室式、容器式吸塵罩等多種型式。需密切與工藝配合，選取適宜的型式科學地確定其排風量。
在藥廠設計中，排風罩的吸氣口宜盡可能靠近污染發生源，一方面因為吸氣口處的氣流流型屬于匯流，速度衰減快，作用范圍小。距離稍遠抽吸效果明顯減弱，不利于排走污染物。如果要有效控制污染物的擴散，在距離不當的條件下，只得加大排風罩，同時提高吸入速度。這樣就使排風量可能成倍增加。排風罩在位置適當的前提下其罩面吸入速度的大小也很關鍵，吸入速度偏小固然不利于排走污染物，但值得注意的是藥廠很多工藝過程的產塵就是藥品本身或者是其輔料。過大的吸入速度，將增大藥品耗損，加大排風系統能耗，以及加大排風末端分離設備的容量及負荷。特別是固體制劑的各制造工序，在生產過程中伴隨產生的塵埃并非別的污染物質而是藥品本身，一般說來并沒有實際危害當然本身很清潔的粉塵經過長時間擱置后會受雜菌污染和其他醫藥品的交叉污染。在確定排風量時不宜盲目加大安全系數。
在藥廠設計中，如果由于生產條件限制，有害物發生源不固定等原因，不能采用局部排風，或采用局部排風后，室內污染物濃度仍超過允許值時，在此情況下，再考慮采用全面通風全面通風也稱為稀釋通風，它一方面用清潔空氣稀釋室內空氣中的污染物、有害物濃度，同時不斷把污染空氣排至室外。使室內空氣中污染物、有害物濃度控制在相關標準規定的最高允許濃度以下。